2022年3月22日，菏泽市博物馆召开会议，专题研究部署2022年度学术科研工作。会上，馆长李悦耕强调指出，现在，学术科研水平已成为衡量一个博物馆知名度和档次的重要标准，也是博物馆进行评估定级的一个重要指标。在这方面，菏泽市博物馆是有欠缺的，与兄弟市博物馆相比是有不小差距的，必须高度重视，迎头赶上。为加强对学术科研工作的组织领导，馆委会借助全市事业单位改革的契机，经过积极争取，已征得市编办批复同意，在馆内设机构中新设了学术科研部，具体负责馆今后的学术科研工作。2022年，馆学术科研工作要重点抓好以下几点：一是结合博物馆评估定级和运行评估有关要求，尽快研究制定出市博物馆中长期学术科研发展规划，做好市博物馆学术科研工作的顶层设计规划。二是借鉴兄弟博物馆的有益经验，在充分调研、认真准备的基础上，尽快筹建市博物馆学术委员会，切实加强对市博物馆学术科研工作的专业领导。三是建立市博物馆自己的学术科研课题库，以学术科研课题为龙头，推动市博物馆的各项学术科研工作走向正轨、取得实效。四是坚持走出去、请进来，多组织举办或参加系列学术科研活动，不断加强与兄弟单位的学术科研交流，逐步提升市博物馆自身的学术科研水平。五是组织力量，尽快启动《沉船遗宝》等反映馆藏文物藏品研究成果的系列学术专著的编制工作。